Proteinski izolati so beljakovinska dopolnila, za katera je značilno, da njihova vsebnost beljakovin presega 90%. Izolati se pridobivajo z mikrofiltracijo ali z metodo ionske izmenjave. Izolati, dobljeni s postopkom mikrofiltracije, veljajo za najčistejšo obliko sirotkinih proteina. S tem postopkom se laktoza in maščoba odstrani iz beljakovin s pomočjo keramičnih filtrov. Beljakovina ostane v prvotnem nepoškodovanem stanju, brez kemikalij. Mikrofiltrirani proteinski izolat je skoraj brez maščobe in laktoze in ima večjo vsebnost beljakovin kot sirotkin koncentrat. Zlahka se absorbira, dobrega okusa in vsebuje visoke aminokisline z razvejano verigo BCAA. Proteinski izolat, pridobljen z metodo ionske izmenjave, loči beljakovine glede na njihov električni naboj. Je dobro topen in ne vsebuje laktoze ali maščob. Vsebuje približno 5% več beljakovin v primerjavi z mikrofiltriranim izolatom. Primeren je za ljudi, ki imajo želodčne težave.